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发酵工程微生物学

光学显微镜分类、结构和基本原理(明场,暗场,相差)

作者 MFermentaion
2025年11月21日 2 分钟阅读
0
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显微镜的发展推动着微生物技术的发展。微生物学中主要应用光学显微镜和电子显微镜两大种类,每一类又根据其功能和用途可分为多种小类。其中光学显微镜又是微生物相关工作从业者最常见的设备。
文章基于Brock Biology of Microorganisms进行整理编辑
微生物书籍 Brock Biology of Microorganisms
2025年11月更新部分照片

01



光学显微镜和电子显微镜
特性
光学显微镜 (LM)
电子显微镜 (EM)
关键差异说明
成像原理 可见光

 (波长约 400-700 nm)
电子束

 (波长极短,约 0.005 nm 或更短)
根本区别

:EM 使用波长极短的电子束代替可见光,这是其超高分辨率的基础。
分辨率 约 200 nm

 (受可见光波长衍射极限限制)
< 1 nm

 (透射电镜 TEM 可达原子级 ~0.1 nm)
核心优势

:EM 的分辨率比 LM 高数百至数千倍,能看到病毒、细胞器、大分子甚至单个原子(TEM)。
放大倍数 最高约 1000-1500倍

 (油镜)
最高可达 1,000,000倍 或更高
EM 能提供远超 LM 的放大能力,观察极其微小的结构。
景深 较浅 非常浅

 (尤其 SEM)
EM (尤其是SEM) 景深非常小,对样品表面平整度和聚焦要求极高。TEM 景深相对较大。
光源 卤素灯或 LED

 (发射可见光)
电子枪

 (发射高能电子束)

透镜 玻璃透镜

 (聚焦光线)
电磁透镜

 (利用磁场聚焦电子束)

观察介质 空气、水或油

 (用于浸没物镜)
高真空

 (必须去除空气分子以防电子散射)
关键操作环境

:EM 必须在真空环境下工作,限制了活体观察和某些样品。
样品要求 相对宽松

:
– 可观察活细胞、组织切片。
– 通常较厚(微米级)。
– 染色(增强对比度)或天然状态(如相差显微镜)。
非常严格

:
– 必须干燥 (真空要求)。
– 非常薄 (TEM 需 50-100 nm 超薄切片)。
– 导电处理 (SEM:喷金/铂等,防止电荷积累)。
– 固定、脱水、包埋 (常用)。
主要限制

:EM 样品制备复杂、耗时、具破坏性,且通常无法观察活体生物样本。
图像类型 彩色图像

 (反映样品的天然颜色或染料颜色)。
或 灰度图像 (如相差、微分干涉)。
灰度图像

 (电子信号强度映射)。
– TEM:内部结构投影(类似X光片)。
– SEM:表面形貌三维感图像。
LM 可呈现颜色信息;EM 图像本质是电子信号,需后期上色(伪彩色)。
操作环境 常压、室温 高真空

 (样品室)
LM 环境更接近自然,便于活细胞观察。
操作复杂性 相对简单易用 非常复杂

 (需要专业培训和操作)

设备成本 相对较低

 (从千元到数十万元人民币)
非常昂贵

 (从数十万到数百万美元/欧元)

维护成本 较低 非常高

 (需要定期维护、耗材、液氮等)

主要类型
– 明场
– 暗场
– 相差
– 微分干涉相差 (DIC)
– 荧光
– 共聚焦激光扫描 (CLSM, 分辨率略优于普通LM)
– 透射电镜 (TEM):观察样品内部超微结构。
– 扫描电镜 (SEM):观察样品表面形貌。
– 扫描透射电镜 (STEM):兼具部分TEM和SEM功能。
CLSM 是 LM 的高端形式,提供光学切片和更高分辨率/对比度。
主要应用领域
– 细胞生物学 (观察活细胞、细胞器轮廓、染色结构)
– 组织学/病理学
– 微生物学
– 材料科学 (宏观结构、缺陷)
– 教育
– TEM:病毒、蛋白质、核酸、细胞器精细结构、材料晶体结构/缺陷。
– SEM:材料断口、表面形貌、纳米结构、花粉、昆虫、细胞表面。
互补性

:LM 用于宏观到亚细胞水平的活体或染色观察;EM 用于纳米到原子水平的超微结构解析。


02



光学显微镜的分类和原理

▼Bright-field Microscope 

明场显微镜是一种光学显微镜,它使用光线在明亮的背景下产生暗图像。它是生物学、细胞生物学和微生物实验室研究中使用的标准显微镜。样品放在玻璃载玻片上,采用光源(通常是卤素灯或发光二极管(LED)灯)照射。光线穿过样品,物镜将图像放大并投射到目镜或相机上。在明亮的背景下,样品呈现暗色,因此称为“明场”。

光线会被载玻片上的样品吸收或则分散,导致亮度的对比,从而能够观察到样品。

现代显微镜的光源为电子光源,光源通过聚光系统聚集在样品上,然后依次通过物镜和目镜放大。物镜一般在10-100倍,目镜在10-30倍。而终放大倍数是两者的乘积,最大放大倍数可达到1000倍以上。0.2μm是光学显微镜的极限,继续增加放大倍数,效果并不理想。这主要受限于光源的波长和物镜系统收光的效率。



数值孔径(Numerical Aperture,简称NA)是光学系统中的一个重要参数,用于描述该系统能够收集光的角度范围。


光学显微镜中,样品之所以能被看见,是因为目标物体和周围环境的光强度不同,对比越强烈,观察效果越清晰。但是对于一些细菌,由于其和周边的液体环境差异较小,难以产生较大差异,因此难以观察清晰。这就需要用到染色技术。

革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌区别及染色原理

微生物染色技术,虽然能够增强对比度,但是会破坏微生物,因此不能观察到微生物的真实状态。相差显微镜(Phase-contrast)和暗视野显微镜(dark-field).

▼Phase-contrast Microscope 

设备成本
需专用棱镜、偏振组件,价格显著高于普通明场显微镜
样本限制
双折射样本(如晶体)干扰偏振光,难以成像;细胞膜 / 细胞质对比度较低
耗材要求
禁用塑料载玻片 / 盖玻片(退偏效应),需使用玻璃材质
光学限制
复消色差透镜可能影响偏振光路径,需谨慎选择物镜

相差是一种光学显微镜技术,用于增加未染色样本的对比度。未染色样本的结构,例如活细胞或其细胞器,在明场照明下观察时可能显得模糊,甚至变得透明。若使用相差显微镜观察相同的样本和结构,就能以更高的对比度和更丰富的细节,清楚呈现这些样本和结构。

原理:当光线穿过细胞时,会发生微小的相位偏移,这些变化是人眼看不见的。在相差显微镜中,这些相位偏移被转换为振幅的变化,这可以观察到图像对比度的不同。

  • 相位物体特性:透明样本不吸收光,但因折射率或厚度差异使衍射光相位延迟约 1/4 波长,而直射光相位不变。

  • 人眼感知局限:无法直接识别相位差,仅能感知光强(振幅)和颜色变化。

  • 干涉增强对比度:通过相位板使直射光与衍射光相位差达 1/2 波长,发生相消干涉(暗反差)或相长干涉(明反差),将相位差转化为光强差异。


应用场景:

  1. 生物医学领域

  • 观察活细胞、未染色组织、微生物等透明样本,避免染色对样本活性的影响,适用于细胞动态监测(如细胞分裂、鞭毛运动)。
  • 可与荧光显微镜结合,同时观察荧光标记区域与非荧光结构。
  • 工业与材料科学

    • 分析透明或半透明材料(如薄膜、胶体)的厚度和折射率差异,检测内部结构均匀性。

    局限性:

    1. 光学伪影

    • 样本边缘易出现光晕(Halos),可能掩盖细节,影响图像清晰度。
  • 分辨率限制

    • 环形光阑限制光学系统数值孔径(NA),导致分辨率略低于明场显微镜,难以观察细微结构。
  • 样本适用性

    • 不适用于厚样本(焦平面外相位差干扰成像),更适合薄样本或单细胞层。
  • 颜色限制

    • 白光下图像呈灰色,绿光滤光片下呈绿色,早期需黑白胶片拍摄,现可通过彩色数字成像改善。

    ▼Dark-field Microscope 

    由左到右分别为:明场显微镜,相差显微镜和暗视野显微镜下的酿酒酵母。


    暗场显微镜是一种光学显微镜,通过特殊聚光器使光线以倾斜角度照射样本,仅样本散射或反射的光线进入物镜,形成明亮样本与黑暗背景的高对比度图像。

    原理:

    阻挡直射光:暗场聚光器内置中央圆形光阑(或遮光板),阻挡中央直射光,仅允许光线从聚光器边缘以 ** 倾斜角度(大孔径)** 照射样本。

    散射光成像:光线照射样本时,颗粒或结构边缘产生散射光,仅散射光进入物镜,背景因无直射光而黑暗,样本因散射光而明亮。

    应用:

    生物学与医学:

    活体微生物观察:如 ** 梅毒螺旋体(Treponema pallidum)** 的快速检测(临床样本中无需染色)。

    细菌与原生动物运动性分析:观察鞭毛细菌的运动(如大肠杆菌)。未染色样本:组织培养物、单细胞生物(如藻类、原生动物)。

    材料科学与工业:

    表面结构研究:纤维、毛发、矿物、晶体、聚合物薄膜的边缘或表面缺陷。

    微小颗粒检测:如陶瓷中的杂质、水中的浮游生物(如硅藻、浮游动物)。

    优点 缺点
    1. 无需染色:保留样本活性,避免染色损伤
    2. 高对比度:适合透明或微小样本
    3. 操作简单:可通过改装普通显微镜实现
    4. 低伪影:成像过程减少人工假象
    1. 光线强度低:需强光源,可能损伤样本
    2. 内部结构难辨:主要观察表面或轮廓,不适用于厚样本内部
    3. 分辨率限制:依赖散射光,细节分辨率低于明场显微镜

    ▼Differential interference contrast Microscope 微分干涉对比(DIC)显微镜

    Differential Interference Contrast(DIC)显微镜技术通过偏振光经棱镜分裂为正交光束,利用样本厚度和折射率差异产生光程差及相位差,经干涉后转化为强度对比,形成伪 3D 效果图像,适用于观察未染色厚样本(如脑切片),尤其适合电生理实验。其 setup 需安装偏振器、物镜专用棱镜、检偏器等组件,需进行Koehler 照明校准和偏振器与检偏器 90 度正交对齐,使用 IR 光源可增强组织穿透性,且需注意避免灰尘影响成像质量。

    酵母细胞的DIC图

    1. 偏振光分光:起偏器将自然光转为线偏振光,经聚光镜棱镜(如 DIC II/III)分裂为正交偏振的两束平行光,间距小于显微镜分辨率。
    2. 样本交互:两束光因样本厚度或折射率差异产生光程差,导致相位差(1/200 至 1 个波长,相机可检测 1/1000 波长)。
    3. 干涉与成像:物镜棱镜重组光束,检偏器将椭圆偏振光转为平面偏振光,相位差转化为振幅差异(明暗对比),形成 3D 浮雕效果。





    The Scientifica SliceScope with DIC components labelled



    • Polariser(起偏器):产生偏振光,使入射光成为具有特定振动方向的偏振光,为后续利用偏振特性成像做准备,常见于偏光、DIC(微分干涉相差)等显微镜技术 。
    • Condenser with quarter waveplate(带四分之一波片的聚光镜):聚光镜汇聚光线照亮标本,四分之一波片可将线偏振光转换为圆偏振光(或反之),在 DIC 等技术中用于调节光的偏振状态,优化成像对比度 。
    • Objective specific prism(物镜专用棱镜):与物镜配合,在 DIC 等工作模式下,对光线进行分光、合光等操作,利用标本不同部位的光程差等差异,将相位差转化为振幅差,实现透明标本的清晰成像 。
    • Nosepiece with prism(带棱镜的物镜转换器):可切换不同物镜,其上棱镜参与光路调控,保障不同物镜切换后,偏振、DIC 等成像模式的光路稳定 。
    • Objective(物镜):放大标本,是决定显微镜分辨率和放大倍数的关键部件,不同物镜适配不同观察需求(如高倍、低倍,常规观察或特殊偏振观察 )。
    • Analyser(检偏器):与起偏器配合,检测经过标本后的偏振光状态变化,通过偏振光的干涉等作用,将标本的结构差异转化为可见的明暗、色彩对比,呈现标本细节 。

    优点:

    • 无需染色即可观察
    • 活细胞和生物体,避免染色毒性;
    • 成像具有立体感(浮雕状),无晕轮伪影;
    • 支持较厚标本的光学切片成像。

    局限性:

    设备成本
    需专用棱镜、偏振组件,价格显著高于普通明场显微镜
    样本限制
    双折射样本(如晶体)干扰偏振光,难以成像;细胞膜 / 细胞质对比度较低
    耗材要求
    禁用塑料载玻片 / 盖玻片(退偏效应),需使用玻璃材质
    光学限制
    复消色差透镜可能影响偏振光路径,需谨慎选择物镜

    An adult Caenorhabditis elegans nematode imaged using DIC by Bob Goldstein

    ▼Fuorescence Microscope 荧光显微镜

    一、定义:

    荧光显微镜,是一种借助荧光或磷光现象实现样本观察的光学显微镜。它的核心奥秘在于,通过激发样本中的荧光分子(荧光染料或自发荧光物质),让这些分子发射出特定波长的光,从而在黑暗背景下形成明亮的图像。与传统明场显微镜相比,荧光显微镜就像是微观世界里的 “聚光灯”,能精准照亮我们想要观察的目标,带来更高的对比度和清晰度。

    Fluorescence Microscope


    二、原理

    荧光显微镜的工作原理,就像一场精密的 “光影魔术”,主要分为以下几个关键步骤:

    荧光激发与发射:光源(如汞灯、LED 或激光)发出的短波长光(激发光),经过激发滤光片的筛选,成为特定波长的光束,照射到样本上的荧光分子。这些荧光分子吸收激发光的能量后,会跃迁到高能态,随后以 ** 长波长光(发射光)** 的形式释放能量,产生绚丽的荧光信号。光路分离:在荧光显微镜中,** 二向色镜(分光镜)** 扮演着 “光的指挥官” 的角色。它能够反射短波长的激发光,使其聚焦到样本上,同时允许长波长的发射光顺利通过,进入检测器。最后,发射滤光片会进一步过滤掉杂散光,只让特定波长的荧光通过,这样,我们就能在目镜或相机中看到清晰、高对比度的荧光图像了。


    三、应用场景

    荧光显微镜凭借其独特的优势,在众多领域都发挥着不可或缺的作用:

    • 生物医学研究:它是生命科学领域的 “火眼金睛”。科学家们可以用它标记细胞膜、细胞器和细胞骨架,观察细胞的内部结构;也可以追踪蛋白质定位、基因表达,深入研究分子机制;还能通过荧光抗体染色,快速检测病原体。例如,在研究癌症细胞的分裂过程时,荧光显微镜能清晰呈现癌细胞内各种分子的动态变化,为癌症治疗提供关键线索。
    • 材料科学:在材料科学的微观世界里,荧光显微镜同样大显身手。它可以用于纳米材料的表征,帮助科学家了解纳米颗粒的分布与相互作用;也能对聚合物与涂层进行分析,检测材料中的荧光添加剂或缺陷。
    • 食品与环境检测:在食品行业,荧光显微镜可以分析食品成分的荧光特性,检测食品质量;在环境领域,它能快速检测水体或土壤中的荧光标记微生物,助力环境监测与保护。
    • 工业与半导体:在工业生产和半导体制造中,荧光显微镜可用于半导体缺陷检测,标记芯片表面的杂质或损伤位点;还能对纺织品与陶瓷进行分析,评估纤维结构和陶瓷孔隙率。

    四、优点

    高灵敏度与特异性:荧光显微镜就像微观世界的 “超级侦探”,能够检测低至单分子水平的荧光信号。结合抗体或基因编辑技术,它可以精准靶向特定的分子或细胞结构,实现高特异性成像。

    动态追踪能力:它支持活细胞实时成像,借助荧光共振能量转移(FRET)等技术,科学家可以观察细胞内的生理过程,如细胞分裂、物质运输等,让微观世界的动态变化尽收眼底。
    多色成像兼容:荧光显微镜具备 “多彩视界”,可同时使用多种荧光染料标记不同靶点,实现多参数同步分析,帮助我们更全面地了解样本的特性。低损伤性:新型荧光显微镜技术,如多光子显微镜,使用红外光激发,大大减少了光毒性,非常适合长时间观察活样本,为生命科学研究提供了有力支持。
    操作便捷性:相比其他一些复杂的显微镜技术,荧光显微镜的样本制备相对简单,无需超薄切片。部分技术,如宽场荧光,还能实现快速成像,提高研究效率。
    五、缺点

    尽管荧光显微镜优势显著,但也存在一些局限性:

    样本制备限制:使用荧光显微镜需要对样本进行标记,无论是荧光染料还是荧光蛋白,都可能会干扰样本的天然状态,影响实验结果。此外,一些样本本身存在自发荧光,这也会对观察造成背景干扰。

    光漂白与光毒性:长时间的光照容易导致荧光分子降解,也就是我们常说的 “光漂白”。同时,激发光可能会对活细胞造成损伤,尤其是紫外光,这对长时间的活细胞观察带来了一定的困难。
    设备成本高:荧光显微镜需要专用的光源、滤光片组和检测系统,高端机型的价格更是高达数十万美元,这无疑增加了研究的成本和门槛。
    分辨率限制:受光学衍射极限的制约,传统荧光显微镜的分辨率大约为 200nm。虽然超分辨率技术(如 STED、PALM)可以突破这一限制,但这些技术操作复杂,对实验人员的要求较高。
    技术门槛较高:选择合适的滤光片、匹配荧光染料以及进行图像分析,都需要专业的知识和经验。对于新手来说,很容易因为参数设置不当而导致信号丢失,影响实验结果。



    参考文献:微生物书籍 Brock Biology of Microorganisms




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